Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Utp18Q5SSI6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Utp18Q5SSI6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Utp18Q5SSI6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Utp18Q5SSI6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Utp18Q5SSI6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Utp18Q5SSI6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Utp18Q5SSI6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Utp18Q5SSI6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Utp18Q5SSI6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Utp18Q5SSI6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Utp18Q5SSI6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms