Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf215Q5SPX3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf215Q5SPX3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf215Q5SPX3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf215Q5SPX3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf215Q5SPX3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf215Q5SPX3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf215Q5SPX3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf215Q5SPX3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf215Q5SPX3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf215Q5SPX3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms