Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PkdccQ5RJI4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PkdccQ5RJI4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PkdccQ5RJI4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms