Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bhlha9Q5RJB0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlha9Q5RJB0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlha9Q5RJB0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms