Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trdv4Q5R1A3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trdv4Q5R1A3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms