Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RilpQ5ND29 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RilpQ5ND29 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RilpQ5ND29 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RilpQ5ND29 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms