Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afap1l2Q5DTU0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afap1l2Q5DTU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afap1l2Q5DTU0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms