Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syce1lQ5D525 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syce1lQ5D525 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syce1lQ5D525 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syce1lQ5D525 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syce1lQ5D525 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syce1lQ5D525 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1lQ5D525 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1lQ5D525 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1lQ5D525 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1lQ5D525 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1lQ5D525 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1lQ5D525 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1lQ5D525 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms