Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf354cQ571J5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf354cQ571J5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf354cQ571J5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms