Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1qtnf9Q4ZJN1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1qtnf9Q4ZJN1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms