Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt35Q497I4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt35Q497I4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt35Q497I4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt35Q497I4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt35Q497I4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt35Q497I4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt35Q497I4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt35Q497I4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms