Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil2Q3V3V9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Carmil2Q3V3V9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms