Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ulk4Q3V129 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ulk4Q3V129 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ulk4Q3V129 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ulk4Q3V129 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms