Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim80Q3V061 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim80Q3V061 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim80Q3V061 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms