Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C87499Q3UX49 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C87499Q3UX49 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C87499Q3UX49 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177 ms