Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klhdc9Q3USL1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klhdc9Q3USL1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klhdc9Q3USL1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klhdc9Q3USL1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Klhdc9Q3USL1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klhdc9Q3USL1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhdc9Q3USL1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhdc9Q3USL1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms