Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Fchsd2Q3USJ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fchsd2Q3USJ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fchsd2Q3USJ8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fchsd2Q3USJ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fchsd2Q3USJ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fchsd2Q3USJ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fchsd2Q3USJ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms