Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vwa5b2Q3UR50 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vwa5b2Q3UR50 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms