Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms