Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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D13Ertd608eQ3UPR8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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D13Ertd608eQ3UPR8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
D13Ertd608eQ3UPR8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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