Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nhlrc4Q3UP44 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nhlrc4Q3UP44 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlrc4Q3UP44 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlrc4Q3UP44 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms