Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp30Q3UN04 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp30Q3UN04 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms