Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E330014E10RikQ3UL33 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E330014E10RikQ3UL33 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330014E10RikQ3UL33 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330014E10RikQ3UL33 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms