Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc61Q3UJV1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc61Q3UJV1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc61Q3UJV1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc61Q3UJV1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms