Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc58Q3UGP9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms