Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmd8Q3UFK8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmd8Q3UFK8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmd8Q3UFK8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd8Q3UFK8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd8Q3UFK8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms