Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl21Q3U410 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl21Q3U410 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl21Q3U410 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl21Q3U410 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl21Q3U410 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl21Q3U410 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl21Q3U410 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl21Q3U410 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl21Q3U410 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl21Q3U410 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl21Q3U410 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl21Q3U410 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl21Q3U410 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl21Q3U410 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl21Q3U410 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms