Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmf1Q3U3R4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmf1Q3U3R4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmf1Q3U3R4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms