Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm4dQ3U2K5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdm4dQ3U2K5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms