Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc38a5Q3U1J0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a5Q3U1J0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc38a5Q3U1J0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a5Q3U1J0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc38a5Q3U1J0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms