Protein–RNA interactions for Protein: Q3U108

Arid5a, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid5aQ3U108 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arid5aQ3U108 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid5aQ3U108 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arid5aQ3U108 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arid5aQ3U108 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arid5aQ3U108 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arid5aQ3U108 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Arid5aQ3U108 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arid5aQ3U108 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Arid5aQ3U108 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arid5aQ3U108 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid5aQ3U108 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid5aQ3U108 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid5aQ3U108 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arid5aQ3U108 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms