Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasip1Q3U0S6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rasip1Q3U0S6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rasip1Q3U0S6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms