Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn4clQ3TYX2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn4clQ3TYX2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms