Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
InipQ3TXT3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
InipQ3TXT3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
InipQ3TXT3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms