Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TchpQ3TVW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TchpQ3TVW5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms