Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt2Q3TTY5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt2Q3TTY5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt2Q3TTY5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt2Q3TTY5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt2Q3TTY5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt2Q3TTY5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt2Q3TTY5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms