Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp39Q3TIX9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp39Q3TIX9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms