Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RubcnlQ3TD16 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RubcnlQ3TD16 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RubcnlQ3TD16 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RubcnlQ3TD16 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms