Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfaip8l3Q3TBL6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms