Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI48

Jsrp1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jsrp1Q3MI48 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jsrp1Q3MI48 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Jsrp1Q3MI48 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jsrp1Q3MI48 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jsrp1Q3MI48 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms