Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa26Q3L180 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa26Q3L180 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.8 ms