Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdgfl1Q2VPR5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms