Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC12,63□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12,62□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC12,62□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,62□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC12,62□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC12,62□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12,62□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,62□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,61□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC12,6□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12,6□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12,6□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC12,6□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12,6□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC12,59□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,59□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC12,59□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,59□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12,59□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12,59□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,59□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,58□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC12,58□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC12,58□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12,58□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,58□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,58□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12,58□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12,58□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12,58□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12,58□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12,57□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC12,57□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC12,57□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC12,57□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,57□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,57□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12,57□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC12,57□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC12,57□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12,57□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,56□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC12,56□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,56□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12,56□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,56□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,56□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12,56□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,56□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12,56□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,56□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,55□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC12,54□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12,54□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,54□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC12,54□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,54□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,53□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12,53□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12,53□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC12,53□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,53□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,53□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12,53□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,53□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,52□□□□□ -0,4
Ush2AQ2QI47 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,52□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,52□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,52□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC12,52□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12,51□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,51□□□□□ -0,41
Ush2AQ2QI47 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC12,51□□□□□ -0,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms