Protein–RNA interactions for Protein: Q0WXH6

Gm7030, MHC class Ib T9, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7030Q0WXH6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm7030Q0WXH6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm7030Q0WXH6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm7030Q0WXH6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm7030Q0WXH6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm7030Q0WXH6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm7030Q0WXH6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm7030Q0WXH6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm7030Q0WXH6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm7030Q0WXH6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm7030Q0WXH6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm7030Q0WXH6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm7030Q0WXH6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm7030Q0WXH6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms