Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VgfQ0VGU4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VgfQ0VGU4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VgfQ0VGU4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms