Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Lrriq1Q0P5X1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Lrriq1Q0P5X1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Lrriq1Q0P5X1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Lrriq1Q0P5X1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Lrriq1Q0P5X1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Lrriq1Q0P5X1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Lrriq1Q0P5X1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Lrriq1Q0P5X1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Lrriq1Q0P5X1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Lrriq1Q0P5X1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Lrriq1Q0P5X1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
Lrriq1Q0P5X1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Lrriq1Q0P5X1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lrriq1Q0P5X1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms