Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Vps8Q0P5W1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33,36■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33,35■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33,33■■■□□ 2,93
Vps8Q0P5W1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,32■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33,32■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33,29■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,26■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Vps8Q0P5W1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33,26■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,25■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33,23■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33,22■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33,21■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33,2■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Vps8Q0P5W1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33,18■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Vps8Q0P5W1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33,13■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33,11■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,11■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33,11■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33,11■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,89
Vps8Q0P5W1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33,06■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms