Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrioQ0KL02 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TrioQ0KL02 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrioQ0KL02 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrioQ0KL02 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms