Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubxn2bQ0KL01 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ubxn2bQ0KL01 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ubxn2bQ0KL01 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubxn2bQ0KL01 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms