Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gcnt1Q09324 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gcnt1Q09324 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gcnt1Q09324 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms